L’innocuité ou éventuellement la phyto-toxicité d’un produit apporté au sol peut être abordée par son effet sur le taux et la vitesse de germination de plantes-test. Un test rapide sur  cresson alénois est une première étape permettant d’écarter des produits potentiellement inadaptés à des usages agricoles. D’autres plantes-test peuvent être utilisées pour des études plus fines, notamment en lien avec leurs symbiotes microbiens (Rhizobium ou champignons endo-mycorhiziens).